畳が「ギシギシ」なる場合は床板の可能性が高いと思われます。「ミシミシ」と「ギシギシ」ではわかりずらいですが、明らかにすれているというよりは床板の木そのものがたわんで音が鳴っているという可能性が高いかと思われます。音が鳴っている箇所の畳を上げ床板の状態を確認し床板だけでなっているかどうか確認することをお勧めいたします。
場合によっては緩んでいる床板をくぎ打ちにより補強することにより床なりが軽減される可能性があります。音がなることについては一概に言えない部分がございますがまずはその箇所をしっかりと確認することをお勧めします。そして大きな音がする場合は木そのものが関係している可能性が高いと思っていいと思います。